Pour les produits issus de l'agriculture biologique, deux grands systèmes de certification cohabitent. Le premier est la certification par tiers, à l'initiative d'une institution, comme pour la réglementation européenne, ou d'un acheteur. Il a pour principal enjeu l'obtention dun label. Le second est celui des systèmes participatifs de garantie, associant producteurs et consommateurs dans les visites des opérateurs et la délivrance de la certification. Sa mise en uvre et ses enjeux sont collectifs, dynamiques et locaux. La Fédération Nature & Progrès, à l'origine du premier cahier des charges de l'agriculture biologique en France, applique encore aujourd'hui ce deuxième mode de certification, alors que la réglementation officielle a évolué vers le premier. Dans ce manuel, Nature & Progrès présente, dans un premier temps, ces deux contextes de certification de l'agriculture biologique dans le monde, et plus particulièrement en Europe et en France. Dans un second temps, les systèmes participatifs de garantie sont définis et le modèle de Nature & Progrès est présenté plus en détails. Ce rapport a pour objectif de servir d'outil didactique d'aide à l'instauration de systèmes participatifs de garantie.